Bioinformatik

Solvit unterstützt auch Kunden die system biologisch orientierte Fragestellungen verfolgen mit verschiedenen sich ergänzenden Leistungen.

Im Bereich Bioanalytik mit -> "Profiling" oder "Fingerprinting" - Methoden (auch "high content" oder "omics" -Methoden genannt)

Diese Methoden dienen der Charakterisierung und Identifikation von biologischen Proben mittels "Fingerprints" der Metaboliten oder Zellstrukturen ("Metabolom", Lipide, Lipidom oder Lipiom, Proteom, Genom) oder der Auffindung von Markern ("signatures", "biomarkers").

Tabelle: "High-content" - Analysen, geordnet nach den Ziel-Molekülen der Analyse, und typische Untersuchungsobjekte

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Im Bereich der System-Biologie orientierten Datenanalyse mit -> Multivariaten Analysen und der Modellierung von "High content" bzw. "omics"-Daten

Dabei werden folgende Leistungen einzeln oder zusammen erbracht:

Anpassung der analytischen Prozeduren zur Datenerfassung (Messung)

Aufbau von Bibliotheken (zB. MS-Datensammlungen)

Anpassung der GC-MS-Dekonvolution (AMDIS-NIST, Agilent, Solvit-Software, Formatumwandlungen, Software-Anpassungen)

Datenverwaltung (Archivierung, Datenbank)

Entwicklung von Auswertungsalgorithmen

Auswertung und Interpretation (multivariate Datenanalyse und moderne Statistik)

Im Bereich der Bioinformatik mit -> Software-Lösungen für die multivariate Daten-Analyse (Statistik)

Installation und Einführung in die frei zugänglichen Software-Packete ADE-4 (basierend auf R) und R (Open Source)

Einbindung in bestehende Systeme in Zusammenarbeit mit den kundenseitigen IT-Verantwortlichen

Scripting und Programmierung (R scripting, SQL, strukturierte Sprachen, OOL)

Grundlagen, Konzepte und Strategien für die Auswertung von komplexen Datensammlungen mit molekularbiologisch-biochemischen Daten sowie Experimental- bzw. Umweltfaktoren (Integration von Daten verschiedener Plattformen und Quellen)

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